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Saverio Vicario

Saverio Vicario was a researcher in CNR -ITB, Bari since 2006 and in staff since 2011 ITB-BA. He left this Institute in October 2016, and now works at CNR – Institute of Atmospheric Pollution Research.

Bio

Bachelor degree in Zoology in “TorVergata” University (Rome) and PhD in ecology and evolutionary biology in Yale University. Its work produced 16 peer reviewed articles in molecular systematics and genome evolution.

From a methodological point of view he has interest in developing and refining statistical methods within phylogenetic approach to study biodiversity in general and biodiversity observed by means of environmental sequencing. From a biological point of view has interest in the mode of evolution of mitochondrial genome and its contribution to organism adaptation.

He participate to the Italian LifeWatch Network and he is member of the SIBE (Societa Italiana di Biologia Evoluzionistica) and BITS (Bioinformatics Italian Society).

View his publications.

Benvenuti!

È con grande piacere che Vi diamo il benvenuto nel rinnovato sito della Sede di Bari dell’ISTITUTO DI TECNOLOGIE BIOMEDICHE che mette in pensione il precedente.

I contenuti hanno subito (e subiranno ancora) aggiornamenti e limature per tenere il passo con le molteplici attività che ci vedono coinvolti.

Speriamo che il lavoro fatto incontri il vostro favore e speriamo di rivedervi presto (e spesso) presso i nostri siti e servizi on-line.

Lo Staff.
Arianna Consiglio | Nicola Losito | Vito Flavio Licciulli | Giorgio Grillo

Vito Flavio Licciulli

ORCID: 0000-0002-1861-8947
ResearcherID: B-8984-2015

Vito Flavio Licciulli obtained a degree in Computer Science at University of Bari in 1992 (110/110).

Since 1994 he is involved in Bioinformatics with the Bari BioInformatics Group and he is currently a researcher at the C.N.R.- Institute for Biomedical Technologies (ITB), Bari (Italy).

He is author/coauthor of more than 40 papers in international journals in the field of Bioinformatics, he has been involved in more 20 national and international project both as participant and as a Principal Investigator, and he has played in several lectures in Bioinformatics courses/masters.

Since September 2020 he is the Responsibile of Bari’s secondary unit of the Institute for Biomedical Researches.

His main research activities are:

  • design, development and maintenance of specialized biological databases, sequence reference databases, biobanks management and associated web interfaces for their public use, querying and data retrieval
  • management and integration of large amounts of biological (Omics) and clinical data (BigData) through the development and implementation of data-warehouses, federated databases and other data integration tools
  • development of advanced computational bioinformatics pipelines for the analysis of high-throughput sequencing data, in particularly for transcriptomics studies
  • development of web portals and web applications for the user-friendly use of bioinformatics software developed by the group or by external collaboration

He actively partecipate in:

  • ELIXIR ESFRI bioinformatics infrastructure activities in Interoperability platform, Data Manager Expert Group and as Local Technical Coordinator for CNR-Bari
  • the Apulia Biobanks working group constituted by AReSS-Regione Puglia

Vito Flavio Licciulli si è laureato in Scienze dell’Informazione presso l’Università degli Studi di Bari nel 1992, con votazione 110/110, discutendo la tesi dal titolo: “Realizzazione di un sistema di interscambio dati tra ambienti CASE”.

Dal 1994 ha inizio la collaborazione con il gruppo di Bioinformatica di Bari del CNR occupandosi delle banche dati di biosequenze. Attualmente è ricercatore presso il CNR – Istituto di Tecnologie Biomediche (ITB), sede di Bari.

È Responsabile della Sede Secondaria dell’Istituto di Tecnologie Biomediche di Bari da settembre 2020

Le sue principali linee di ricerca scientifica e tecnologiche sono:

  • Progettazione, sviluppo e manutenzione di banche dati biologiche specializzate, di sequenze di riferimento, di gestione biobanche e relative interfacce web per la loro pubblica consultazione, interrogazione ed estrazione dati
  • Gestione ed integrazione di grandi quantità di dati biologici e clinici (BigData) mediante lo sviluppo e l’implementazione di data-warehouse, database federati e altre tecnologie di integrazione dati;
  • sviluppo di complesse pipeline bioinformatiche per l’analisi di dati provenienti da sequenziamento massivo, in particolare per studi trascrittomici;
  • sviluppo e manutenzione di portali web e applicazioni web per il pubblico utilizzo alla comunità scientifica dei software bioinformatici sviluppati dal gruppo o in collaborazione.
    Inoltre, partecipa attivamente alle attività:
  • dell’infrastruttura di ricerca europea ELIXIR nella piattaforma Interoperability, nel Data Manager Expert Group e come Local Technical Coordinator di CNR-Bari
  • del gruppo di lavoro sulla organizzazione delle Biobanche Pugliesi per la crio-conservazione del materiale biologico istituito dall’AReSS-Regione Puglia.

E’ autore/coautore di più 40 articoli su riviste internazionali nel settore della Bioinformatica, ha partecipato a circa 20 progetti internazionali, nazionali e regionali di cui alcuni come “Principal Investigator” per l’ITB, ed ha svolto docenze di Bioinformatica in diversi corsi/master.

Andreas Gisel

Andreas Gisel is a Bioinformatician with a Diploma and PhD in Natural Science (specialized in Molecular Biology) from the Swiss Federal Institute of Technology Zürich, Switzerland.

He has more than 10 years’ experience in molecular biology accumulated during his PhD, working for 4 years at UC Berkeley, USA and 2 years at Friedrich Miescher Institute (a Novartis foundation) in Basel, Switzerland.

Over time he specialized in Bioinformatics working at Novartis SA in Basel, Switzerland, focusing on cancer research and last at the Institute for Biomedical Technologies, Bari, Italy, specializing in plant-virus interaction.

Over the last 20 years he developed skills in Next Generation Sequence data analysis, biological databases, and also has a long-standing experience in teaching. He was working for 3 years at the International Institute of Tropical Agriculture (IITA) Ibadan, Nigeria and continues offering consultancy up to date.

During this time at IITA he has been working with cassava, yam, and maize on gene expression analysis. He was responsible for several projects on cassava improvement and looking at molecular features to propose biotechnological approaches to increase yield, starch content, and virus resistance and to improve food quality by biofortification.

His contats here at Bari’s offices of the Institute for Biomedical Technologies are: