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Vito Flavio Licciulli

Vito Flavio Licciulli obtained a degree in Computer Science at University of Bari in 1992 (110/110).

Since 1994 he is involved in Bioinformatics with the Bari BioInformatics Group. He is currently a researcher at the C.N.R.- Institute for Biomedical Technologies (ITB), Bari (Italy).

His main research activities are: design, implementation and maintenance of biological databases and data-warehouses; management and integration of large amounts of biological data (BigData); development of bioinformatics analysis pipelines and WEB interfaces.

He is author/coauthor of more than 30 papers in international journals in the field of Bioinformatics, has been involved in more 20 national and international project both as participant and as a Principal Investigator, and has played in several lectures inb Bioinformatics courses/masters.

He is also responsible of database and computer server management at ITB-CNR-Bari institute.


Vito Flavio Licciulli si è laureato in Scienze dell’Informazione presso l’Università degli Studi di Bari nel 1992, con votazione 110/110, discutendo la tesi dal titolo: “Realizzazione di un sistema di interscambio dati tra ambienti CASE”.

Dal 1994 ha inizio la collaborazione con il gruppo di Bioinformatica di Bari del CNR occupandosi delle banche dati di biosequenze. Attualmente è ricercatore presso il CNR – Istituto di Tecnologie Biomediche (ITB), sede di Bari.

Le sue attività scientifiche sono: “Progettazione e sviluppo di banche dati biologiche specializzate” sviluppate sia dalla Sezione di Bari, sia in collaborazione con altre istituzioni scientifiche; “Gestione ed integrazione di grandi quantità di dati biologici (BigData)”; “Sviluppo di applicativi e pipeline di analisi bioinformatica” e “Sviluppo di applicazioni web” per la loro fruizione.

E’ autore/coautore di circa 30 articoli su riviste internazionali nel settore della Bioinformatica, ha partecipato a circa 20 progetti internazionali, nazionali e regionali di cui un paio come “Principal Investigator” per l’ITB, ed ha svolto docenze di Bioinformatica in diversi corsi/master.

Inoltre è responsabile sia della gestione e mantenimento delle banche dati biologiche, sia del supporto sistemistico dei computer server presenti presso l’istituto.

Andreas Gisel

Andreas Gisel has a degree in Biology from the Swiss Federel Institute of Technology, Zurich, Switzerland and got his PhD in Biochemistry and Molecular Biology for the same Institute.

He is PI within the FP 6 project EMBRACE, member of the executive board of EMBnet and editorial board of the EMBnet.news.

His main interests are sequence analysis of NGS data, applied gene ontology and GPU oriented bioinformatics applications.

His contats here at Bari’s offices of the Istituto di Tecnologie Biomediche are:

His most recent work is on the COST Action BM1006, which activities are summoned up on the dedicated website: http://www.nextgenerationsequencing.it

Angelica Tulipano

Angelica Tulipano Laureata in Fisica all’Università di Bari nel 2003, collabora dal 2004 con l’Istituto di Tecnologie Biomediche.

Ha conseguito il PhD in fisica in collaborazione con l’INFN nel 2008 con una tesi dal titolo ‘Una metodologia basata su algoritmi di clustering per l’analisi globale dei dati di microarray’.

L’attività di ricerca svolta nel campo bio-informatico finora ha riguardato l’utilizzo della Gene Ontology per la ricerca di analogia funzionale tra prodotti genici che ha portato alla pubblicazione del seguente lavoro:

Gene analogue finder: a GRID solution for finding functionally analogous gene products
A. Tulipano, G. Donvito, F. Licciulli, G. Maggi and A. Gisel
BMC Bioinformatics 2007, 8:329

Altre attività riguardano l’analisi di dati da microarray con tecniche di clustering, che recentemente ha portato alla pubblicazione di:

GRID distribution supports clustering validation of large mixed microarray data
A. Tulipano, C. Marangi, L. Angelini, G. Donvito, G. Cuscela, G. Maggi and A. Gisel
2011 – EMBnet.journal, vol 17, No 1

e l’analisi di dati di sequenziamento massivo con tecniche Next Generation Sequencing, in particolare la creazione di workflow per l’analisi di sequenze di small RNA.

Dal 1° Agosto 2016 ha concluso le sue attività con il CNR, diventando un’insegnante a tempo pieno del MIUR.


[English version]

I’m graduated in Physics in 2003 at the University of Bari.

I have terminated my PhD in 2008 in Physics with a theses on ‘A methodology based on clustering algorithms for a global analysis on microarray data’.

Since 2004 I’m working in collaboration with the ITB on different bioinformatics topics: the use of Gene Ontology to evaluate functional analogies between gene products, the analysis of microarray data and lately the creation of a workflow for the analysis of massive Next Generation Sequencing data.

1st Aug. 2016 Angelica leaved CNR for a full time position at MIUR.

Elda Perlino

Elda Perlino is actually Senior Scientist at the CNR Biomedical Technologies Institute (ITB) via Amendola 122/D, Bari, Italy.

Starting from 1983 during a 3 years stage at the EMBL (Heidelberg-Germany) in the Molecular Biology Laboratory directed by Prof. R. Cortese, she has been involved in studies concerning the molecular basis of human proliferative diseases by investigating the regulation of expression of growth and adhesion factors in normal and neoplastic cells.

Actually her research activity is focalized on the study concerning the molecular characterization of cell malignant transformation in an in vivo model system of human tissues with particular attention to the regulation of expression of tumour suppressor-like factors in hormonally regulated human carcinoma, such as thyroid, prostate, mammary and endometrial carcinoma.

Up to now she has published 46 scientific publications (ISI) and 10 books with international editorial board.

You can find more on her personal website HERE.