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Gli scorsi 5, 6 e 7 dicembre a Bari c’è stato il 4° Workshop su Next Generation Sequencing ed Epigenomica dove si è discusso di:

  • ChIP-Seq for the study of chromatin structure and Transcription Factors interactions
  • Methylome analysis
  • RNA-Seq analysis for estimating expression profiles and alternative splicing pattern
  • ncRNAs and epigenetic regulation
  • Advances in high-throughput sequencing platforms, storage and retrieval of data
  • Data integration and System Biology models

Il personale della nostra Sede ha partecipato a livello di comitato organizzativo del workshop con Domenica D’Elia e Sabino Liuni e con la partecipazione di alcuni ricercatori ed assegnisti per abstract e poster session.

Bioinformatics meets Biology

Si è tenuta ieri – come annunciato sul sito NextGenerationSequencing.it ed in altre sedi, un paio di mesi fa circa – il meeting Bioinformatics meets Biology.

L’evento organizzato dal ricercatore Andreas Gisel dell’ITB Bari, in collaborazione con altri colleghi di questo Istituto e non, ha visto la partecipazione di ben 35 ricercatori diversi, provenienti da ben 11 Istituti/Enti di ricerca.

Ringraziamo i partecipanti ed i relatori che hanno permesso l’ottima riuscita del meeting.

Gentilissimi Colleghi, dal 12 al 14 ottobre si svolgerà presso il Salone degli Affeschi del Palazzo Ateneo dell’Università di Bari, la  terza edizione del Workshop Internazionale “Next Generation Sequencing”.

Organizzato da ITB e IBBE in collaborazione con l’Università degli Studi di Bari e il CASPUR, il workshop è supportato dal Dipartimento Scienze della Vita ed è sotto il patrocinio della Società Italiana di Bioinformatica.

Come nelle scorse edizioni, l’obiettivo del workshop è quello di offrire una panoramica sui più recenti avanzamenti delle diverse tecnologie di NGS e delle strategie di analisi dei dati, in un ampio spettro di applicazioni. Il programma prevede “invited lectures” da parte di ricercatori di levatura internazionale, relazioni selezionate tra gli abstract che verranno sottomessi e una poster session.
Il programma prevede anche un hands-on tutorial sull’uso di Chipster per l’analisi di dati NGS e altre applicazioni (Massimiliano Gentile – EMBnet-CSC, Finland). Il tutorial si svolgerà la mattina del 12 Ottobre presso l’Aula 1 della Facoltà di Scienze Biotecnologiche dell’Università di Bari (via Fanelli, 204). La partecipazione al tutorial è gratuita ma ristretta a 25 partecipanti, per cui è soggetta a selezione.  Il form per inoltrare la richiesta di partecipare al tutorial è disponibile presso il sito web del workshop, nella sezione dedicata alla registrazione.

A conclusione del workshop è prevista una tavola rotonda nella quale verrà presentata e discussa l’iniziativa “NGS network Italia” per favorire la collaborazione e l’interazione tra i gruppi di ricerca.

Tutte le informazioni relative al programma e all’organizzazione del workshop sono disponibili presso il sito web, dove è possibile effettuare la registrazione online e la sottomissione di abstracts.

Vi segnalo che la sottomissione degli abstracts si chiude il 23 Settembre. Entro il 25 Settembre saranno inviate le notifiche agli autori selezionati per una comunicazione orale.
Le registrazioni si chiudono il 28 Settembre.

Cordiali saluti,
Domenica D’Elia
Comitato Organizzativo “NGS Workshop” 2011

Lo staff informatico dell’ITB (sede di Bari) è lieto di annunciare la pubblicazione del nuovo portale http://ngsnetwork.ba.itb.cnr.it.

Scopo dell’iniziativa sponsorizzata da Istituti del CNR quali l’ITB, IBBE, IGB, RGB e IGA e patrocinata dal DSV-CNR, è quello di condividere informazioni riguardati:

  • i laboratori italiani pubblici e privati, i centri di servizio, le aziende produttrici in possesso di piattaforme  di next generation sequencing (NGS);
  • i progetti di ricerca in corso presso questi laboratori;
  • i gruppi di ricerca attivi nello sviluppo di strumenti bioinformatici e le risorse computazionali disponibili;
  • le problematiche legate ai protocolli di sequenziamento NGS;
  • la programmazione di congressi, corsi di formazione, workshop, tutorials ed eventuali bandi di progetti di ricerca nell’ambito di NGS.

Invitiamo quindi gli interessati a partecipare e a contribuire a questa iniziativa, magari iniziando con la propria registrazione compilando l’apposita form.